よっぽど 友達がいないんだろうねって英語でなんて言うの？

どちらも日本語では「彼には人間の友達は一人もいないってことかな」という風に訳せると思いますが、微妙なニュアンスの違いがあります。guess の方がsupposeよりいい加減な感じがします。この例文でここまで細かく考えるのも変ですが、特に違いが分かりにくいと言われる３つを以下に書いてみます。

think ＝考える（いろいろ考えた結果私はこう思う）
suppose ＝ 根拠に基づいて推測する（確信はないけど状況から考えるとそうなんじゃないか）
guess ＝ 根拠は特になくてもとりあえず推測（もしかしたらこうかも）

歌詞から推測するに、きっと友達いないんだね…と考えるのか、よく分かんないけど、もしかしてこいつ友達いないの？という感じなのかの違いだと思います。

この場合、「友達がいない」というのは、「友達が少ない」というより「人間の友達がいない」という意味に近いと判断しました。

「must」＝「〜に違いない」

既に回答いくつか挙がっていましたので、意訳して別の言い方で考えました(^_^)
I wish he could make friends with humans.
「彼が人間と友達になれることを私は望む」が直訳で、つまり、「人間とも友達になれたらいいんだけどね」という感じのニュアンスです。

かなり皮肉たっぷりな言い方です(^_^)