もっと沢山入ってるものはありませんか？って英語でなんて言うの？

"another one" は「もう一つの別のもの」を表し、それが同じ商品であることを暗に示します。 "which" は前の物を修飾するので、後ろにはその物の説明が続きます。 「(鉛筆・シャープペンシルなどの)芯」は "lead" です。"more leads" で「より多くの芯」となります。 "in it" の "it" は「ケース」を表し、「ケースの中に」ということになります。"in a case" としても良いのですが、状況から「ケース」であることは明らかなので、"it" で文をすっきりさせます。