「え？その”それ”って何？」って英語でなんて言うの？

まずは、そのまま、“あなたが言っている ”it” って何のこと？” という意味で； “What's "it"?" （ “it” って何？） と聞けますが、ちょっと短くてラフ。特別な気を遣わなくてもいい場合は、この表現で全然問題無いんですが、相手からの追加質問を防ぐため、または一発で自分の聞きたいことを理解してもらうためには、二個目、又は三個目の、もうちょっと詳細を含めた形の方がいいかもしれませんね。 例えば二個目： “What are you talking about?” （ ”何のことを言っているの？” ） とか、三個目の例文： “What are you referring to?”　（ ”何を指しているの？”、　”どういう意味？”、　 ”何のことを言っているの？”） また、「複数の会話が同時進行している」状況では； “I wasn't listening.” （ ”今聞いてなかった” →　“今聞き逃した”　→　その状況の中だと自然に、“今違う話しをしていたから”　というニュアンスで聞き取ってくれます。）、 又は、 ”Sorry, I was talking to him/her/them”　（ “ごめん、今 “あっち” ／ “彼” ／ “彼女” ／ “彼ら” と話していた。” ）　 などと事前に言うといいかもしれません。

the "it" という言い方も可能ですよ。 「ホームアローン３」（Home Alone 3）という映画で 弟に関する大事な問題を it と言われた時に The "it" you're referring to is my little brother. あなたが it と呼んでいるのは私の大事な弟なの！ という表現が出てきます。 ですので可能ですが、Hara Ken先生のおっしゃる表現の方が ここでは自然かと思います。