生徒の多くはピンと来ていない様子だったって英語でなんて言うの?
差別に関する学習をしたが、残念なことに生徒の多くは、差別はいけないことだとは頭では理解しているものの、ピンと来ていない様子だった、と伝えたい。
回答
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It appeared that many students did not understand the core intent of ~.
「ピンと来る」を「核心部分を理解する」と解釈して、”core intent of ~”という表現をつかってみました。
”~”は、状況に依りますが、仮に「あなたの主張/訴え」を置きたいのであれば、”your points”や”your argument”などが候補になります。
回答
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It seemed that many of the students did not understand.
■it seemed that ~
「それは~のように思える」
※that 以下には S(主語) V(動詞)を入れて使ってください。