it は ココアを指しています。
冷たいのが良い？と聞く場合にはDo you want to have it cold?
冷たいのと温かいのとどっちが良い？Would you like to have it cold or warm?
などでも使って頂けます。
ココアなのでwarm upとさせていただきましたが、もし食べ物などを温める場合は、
Do you want me to heat it up? に変えて使った方が適切です。
この場合、次のような言い方ができますよ。
ーDo you want me to heat it up?
「温めてほしい？」
ーDo you want it hot or cold?
「熱いのがいい、それとも冷たいのがいい？」
ーIs it okay just to drink it cold?
「冷たいまま飲むのでいい？」
ご参考まで！
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