It is so hard to understand all the railway lines in Tokyo
The train route map in Tokyo is way too complicated for me
The train route map in Tokyo is very confusing and hard to find which one I should take
"hard to undestand 〇〇"で「理解するのが大変」となります。
"way too 〇〇（形容詞）"で「〇〇過ぎる」という表現です。
"complicated"で「複雑な」という意味なので「複雑過ぎる」となります。
別の表現としては"confusing"で「分かりにくい」という言い方もできます。
"hard to find which one I should take"で「どれに乗れば良いのかを見つけるのが大変」となります。
路線図は"Train route map"が一般的かと思います。
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