Is that course offered throughout the year?で、「そのコースは、一年を通して開講されていますか」となります。
Throughout the yearの代わりに、all year around(一年中)というのもありです。
ちなみに、「そのコースは、毎学期開講されていますか」は、Is that course offered in every semester?です。
'available'は「入手できる」という意味なので、「開講されている(開催されている)」という意味で使うことができます。
'whole year'で「一年中」という意味にもなるので、
「そのコースは通年開講されていますか?」は
Is that course available for whole year? で 表現できます。