Table seats are fine with us. Thank you.
テーブル席で大丈夫です。ありがとうございます。
- is fine with me(us)：〜で構いません。〜で大丈夫です。
となります。
補足ですが、状況によっては
We appreciate your (generous) response.
（気前良く）お返事をくださりありがとうございます。
など調整してくれた事に対してお礼を添えるといいかもしれませんね。
table of 4 ４人席
カウンターかテーブル、などの選択肢があってもなくても、レストランは大概テーブルが基本で、「テーブルを予約する」という言い方をします。
ソファがなくてテーブルです、と丁寧に返信されたとのことですので、
We will get a table, please. 「テーブルにします」
Sure. We will reserve a table. 「わかりました、テーブルを予約します」
より丁寧さを増して回答されたい場合は、
We would be happy to reserve a table if possible.
We would like to reserve a table if it is still available.
よければテーブルを予約いたしたいと思います
などとされると良いです。
日本 
