そのタバコのカートンは品切れでバラならありますって英語でなんて言うの？

品切れは「out of stock」と言います。
逆に、品があるなら「in stock」と言います。

タバコの箱はそのまま「box」です。

従って、「We're out of stock on cartons for that, but we have boxes」を提案しました。

これで、ボックス売りなら可能と言うことがお客様に伝わります。

品切れを英語で表現する際には、「out of stock」というフレーズを使用します。また、単品で提供できる場合、「individual packs」という表現を使うことができます。

したがって、お客様に対して「そのブランドのカートンは現在品切れですが、個々のパックはご利用いただけます」と伝える場合、「We're currently out of cartons of that brand, but we do have individual packs available.」と表現することができます。