"Did you understand" とは「～は理解しましたか？」という意味です。何か確認したいとき、これを聞けます。
そして、"what" とは「どのような」を表します。その次、"documents" を書いてますので、「どのような書類」と翻訳します。
最後に "are necessary" は「必要」を指します。
したがって、"Did you understand what documents are necessary?" 「どのような書類が必要かを理解しましたか？」
その上、「書類を準備出来ているか確認したい。」を翻訳したい場合、"I want to confirm whether you've been able to prepare the documents"になります。
アメリカ合衆国 
