それは大変だったんですね〜って英語でなんて言うの？

そんな大変なことがあったんですね。
の意味です。

have a hard time「苦労する、大変な目に遭う」

That must've been hard/tough.
"それは大変だったんですね〜" と言う意味です (難しいことがある時).

That must've been terrible.
"それは大変だったんですね〜" と言う意味です (恐ろしい、ひどいことがある時).

「それは大変だったんですね」は英語でThat is/was really terrible, isn’t/wasn’t itとかThat is/was really hardです。悲惨な出来事があった時に、相手をいたわりたい時に使われます。もう一つの翻訳がThat is/was the difficultです。例えば：
A: The tornado damaged my house. （竜巻は私の家を損害しました。）
B: Ah, that’s terrible!　（それは大変ですね。）

That must have been tough.
それは大変なことだったにちがいないよね。
I'm so sorry for you.
心から同情します。
 
That must have been tough. は起きた出来事に対してフォーカスしているのに対し、
I'm so sorry for you. は相手の気持ちにフォーカスしているので、後者の表現を使った方が、相手に対する労わりが伝わると思います。