東京から京都まで電車で二時間って英語でなんて言うの？

「X から Y まで行くのは〜かかります」とは It takes (時間）to go from X to Y　という形の文章です。 「行くのは」を取り除いたら、It is (時間）from X to Y. か X is (時間) from Y. とも言えます。

A trip from Tokyo to Kyoto（ 東京から京都までの距離は） takes 2 hours（ 2時間 かかる） by train（ 電車で） 2 hours by train（ 電車で2時間） is （ それは）how long it takes from Tokyo to Kyoto（ 東京から京都までの 時間です）