I have a whole day to transit so I would like to retrieve my baggage
質問者様のお求めの英語は「I have a whole day to transit so I would like to retrieve my baggage」になります。
もっと良いのは、トランジット地がわかれば、上記の文書に入れておくことです。
フランクフルト経由ですので、パリ空港のチェックインカウンターにて「I have a whole day to transit in Frankfurt, so I would like to retrieve my baggage there, and check it back in before I board my flight to Narita」と言えば受け付けてくれるはずです。
しかしながら、恐らく、フランクフルト→成田行きの便は再チェックインが必要になるかと思われます。