言語の違いって英語でなんて言うの?
例えば、同じ日本国内であっても、東北弁と関西弁の違いは方言の違いですが、日本語とアイヌ語の違いは言語の違いと言えると思います。
回答
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two different languages
日本語とアイヌ語が全然違う言語と言う文脈であれば「2つの異なる言語」と少し意訳をして解釈をして two different languages と言うといいですね。
The Japanese and Ainu language are two different languages.
日本語とアイヌ語は2つの異なる言語です
The Tohoku dialect and Kansai dialect are two different dialects in Japan.
東北弁と関西弁は2つの異なる日本の方言です