「通過する」は英語で "to pass" と言います。なので「〇〇駅を通過した」と言うならば、"We passed 〇〇." を使います。
また、「通過駅」は "nonstop station" とも言います。
例文：
"The train passes every station till Kyoto." 「ここから京都までの駅は通過します。」
"The closest station from my house is a nonstop station." 「私の最寄駅は通過駅です。」
ご参考になれば幸いです。
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