unfortunately we are currently out of ○○, if it's alright how would you like ○○ instead?
we don't have ○○ at the moment, can I get your something else instead?
最初の例文は"生憎○○を切らしています、代わりに○○はいかがですか?"と言う形になりますね。こちらの例では「unfortunately」で"生憎"と表し"切らしている、○○が無い"は「out of ○○」となります。"代わりに~"は「instead」です。
次の例文は"現在○○が有りません、代わりに何か用意致しましょうか?"と言う表現になります。