有料でビジネスクラスにアップグレードできますか？　って英語でなんて言うの？

「有料で」は for a fee/for a charge で言うことができますが、この場合に pay extra にすれば自然的な言い方になると思います。

直訳するとこれが「余分を払う」ということになり、（決めてある値段よりもっと払う）意味になります。

例文　If I pay extra, can I get an express delivery?
「有料で速達便ができますか？」

参考になれば幸いです。