普段は伝わらないと思います。聞き手はすぐ理解できることではありません。"Any."だけと言われたら、 "Excuse me?", "Sorry?" などと答えるのは普段と思います。"Anything." と言ったほうがいいです。
でも、こういう風に聞かれたら： "Which OO do you want?" 、"Any."だけで答えては「なんでもいい」と伝わると思います。しかし、これは正しい英語ではありません。本当は "Any OO (is fine)." と言うべきです。
例：
（１）
Which colour would you like?
何色がいい？
Any. (Any colour. が正しい）
何でもいい。 これはいけますがとても子どもっぽいです！
（２）
What do you want to eat?
何を食べたいの？
Any.
これはおかしいです！"Anything." と言ったほうがいいです。
アイルランド 
