If you're going to eat snacks, then don't waste any of them.
Not all kids can eat yummy snacks like these, so you should be more thankful.
「大事に食べなさい」は下のように言うのはどうでしょうか?
ーIf you're going to eat snacks, then don't waste any of them.
「お菓子を食べるなら、無駄にしないの。」
don't waste any of them を直訳すると「どれも無駄にしない」となり「残さないで食べなさい」というニュアンスになります。
ーNot all kids can eat yummy snacks like these, so you should be more thankful.
「子供達がみんなこんな美味しいお菓子を食べれるわけじゃないんだよ。だからもっと感謝して食べなさい。」
yummy snacks 「美味しいお菓子」
be more thankful「もっと感謝する」
ご参考まで!