ご質問ありがとうございます。
実際に自律神経の英語を調べないといけませんでした。autonomic nervesはあまり使われていない言葉からです。もし、相手もその単語が知らなかったら、autonomic nerves are nerves that control our body subconsciously. と説明できます。subconsciouslyの代わりにautomaticallyも言えます。
例文:Acupuncture is very useful in adjusting autonomic nerves.「鍼治療は自律神経の調整にとても効果がある」
ご参考いただければ幸いです。