"入金金額"は「deposit amount」で合っていますね。「deposit」は"預ける"または"寄託する、供託する"と言う意味になり「amount」はこの場合では"額"という意味になります。「amount」は他にも"合計"や"総数"または"○○に等しい"と言う意味にもなります。
例
・The deposit amount of the account was $5,000(口座の入金金額は5,000ドルでした)
"Deposit amount"として表現できます。
Deposit amountは、「入金金額」に相当します。
他の表現法としては,amount depositedと言えば「預け入れた金額」を意味することができます。funds depositedなら「預金された資金」です。
例文を参考にしてください:
The deposit amount will be reflected in your account soon.
入金金額はすぐにあなたの口座に反映されます。