悪く言うわけではないのですがって英語でなんて言うの？

offend は「（相手の）気分を害する、気を悪くさせる」という意味で、
名詞の offense には「気持ちを害するもの」「無礼」のような意味があります。

上記の表現はどちらとも、
「あなたの気を悪くさせようしてるわけじゃないんだけど…」
「悪気はないんだけど…」
というような表現です。

Don’t take this personally....は 前提となる言動などがあって、「それを個人的な意味で受け取らないでね」という意味です。

Don’t take this personally but we all need to get along with one another. 「個人的にな意味で受け取らないで欲しいんだけど、私たちみんなお互いと仲良くしないとね」。
と言う場合に使います。

ビジネスシーンなら
This a business decision, not personal. と言います。これは、
「この決定はビジネスで個人的な意味はないよ」と言う意味です。

参考までに！