If you keep your desk well-organized, you will be able to focus better on whatever that you need to do.
ご質問ありがとうございます。
"If you keep your desk well-organized"=「もし机の上を綺麗にしておくと」
"you will be able to focus better"=「もっと集中することができる」
☆"focus"の代わりに同義語である"concentrate"も使えます。
"on whatever that you need to do."=「あなたがしなければいけないことに対して。」
ご参考に!
Keeping your desk clutter-free helps you focus better.
・Keeping your desk clutter-free helps you focus better.
(机の上をごちゃごちゃさせず常に散らかさないでおくと、より集中しやすくなります)
・Keeping your desk clear of items boosts your concentration.
(机の上に物を置かずすっきりさせておくと、集中力が増します)
「ホコリがない状態ではなく、物が置いていない状態」を表すには、clutter-free(散らかりのない、物がごちゃごちゃ置かれていない)や keep your desk clear / clear of items(机の上に物を置かずに片付いた状態にしておく)という表現がぴったりです!
また、「集中力が増す」は boosts your concentration(集中力を高める・増す)や helps you focus better(より集中するのを助ける)と言うと、ネイティブらしくとても自然に伝わります。