「普段使わない筋肉を使った」は英語で
I used muscles that I don't usually use.
のように言えます。
muscles で「筋肉」
usually で「普段・通常」
例:
I'm in pain because I used muscles snowboarding that I don't usually use.
「スノボで普段使わない筋肉を使ったので体が痛い」
to be in pain で「痛みがある」
to snowboard で「スノーボードをする」
ご参考まで!