There are 52 pieces that fit in the tray but only 40 pieces are written on the document, so are you sending an incomplete amount?
「半端」は英語で「incomplete」と言えます。「数」の場合、「amount」と言います。ですので、「半端な数」は「incomplete amount」になります。
質問するとき「送ってくるの」は「are you sending？」を聞けます。全体的に「Are you sending an incomplete amount」になります。
英文を英訳したい場合、下記のようになります：
「There are 52 pieces that fit in the tray but only 40 pieces are written on the document, so are you sending an incomplete amount?」
最初の部分で「1トレー52個入りのはずなのに40個と書類に書かれていたので、」という意味です。そして、最後の部分で質問に置きます。「are you sending an incomplete amount?」は「半端な数を送ってくるの？」という意味です。
"Do they send it in incomplete quantities?"
「規定数に満たない数量で送ってくるのですか？」という意味です。
* "Will they ship it in odd numbers?"
“odd numbers” は「端数・きりの悪い数」という意味で口語的です。ただし「奇数」の意味もあるので、カジュアルな会話では問題ないですが書類には向きません。
* "Are they going to send less than a full tray?"
「満杯のトレー未満で送るのですか？」という具体的な言い方です。
アメリカ合衆国 
