My apologies, we don't have this item in stock right now. Do you mind waiting until it comes in?
ーI'm sorry but you'll have to order this item.
「すみません、こちらの商品はご注文になります」
you'll have to order ... を使って「ご注文になります」と表現します。
ーMy apologies, we don't have this item in stock right now. Do you mind waiting until it comes in?
「申し訳ありません、只今この商品の在庫を切らしています。入荷するまでお待ちいただけますか？」
在庫を切らしている場合は、このように表現してもいいですね。
to have ... in stock で「…の在庫がある」
ご参考まで！
・That item would need to be ordered.
「その商品はお取り寄せ（ご注文）になります。」
これはとても自然で、少し丁寧な言い方です。
would need to ～ を使うことで、やわらかく案内する感じになります。
日本語の「ご注文になります」にかなり近い接客表現です。
・We can order that item for you.
「その商品はお客様のために注文できます。」
＝「その商品はご注文いただけます。」
カナダ 
アメリカ合衆国 
