気が付いたときには手遅れって英語でなんて言うの？

詳しいシチュエーションがわかりませんが、次のように言えると思います。

ーBy the time you realize it, it will be too late.
「あなたがそれに気がついたときには、手遅れでしょう」

ーWhen you realize ..., there will be nothing you can do about it.
「…に気がついたときには、それについてあなたができることは何もないでしょう」＝「手遅れだろう」

ご参考まで！

おっしゃられている内容は、以下のようにも表現できます。
It'll be too late when you realize it.
「それに気づいた時は手遅れになっているだろう」

too lateは「遅すぎる」が直訳ですが、「手遅れ」と言いたい時にも使えます。

以上です。
少しでも参考になれば幸いです(^_^)