私の授業を受けてくれてありがとうって英語でなんて言うの？

この場合、次のような言い方ができると思います。
ーThank you for taking my class.
「私の授業を受けてくれてありがとう」

ーI'm glad you were in my class.
「私の授業にあなたがいて嬉しいです」＝「私の授業を受けてくれて嬉しいです」

ーIt was great teaching you.
「あなたのことを教えることができて良かったです」

ご参考まで！

こんにちは。
様々な言い方ができると思いますが、例えば以下のような英語表現はいかがでしょうか：

Thanks for taking my class.
私の授業を受けてくれてありがとう。

Thanks for ... で「〜ありがとう」となります。

ぜひ参考にしてください。

ご質問ありがとうございます。

まず、「私の授業を受けてくれてありがとう」というのを「私の授業に出席してくれてありがとう」と言い直して、

Thank you for attending my class.

と表現することが出来ます。

ただ、「授業」というのが「毎回の授業」（複数）を指すのであれば

Thank you for taking my lessons.
「私の（いくつかの）授業を受けてくれてありがとう」

ということが出来ます。

ご参考になれば幸いです。