No matter how cloudy it gets, there is always a blue sky above the clouds.
こんにちは!
ご質問ありがとうございます。
『どんなに曇ろうとも、雲の上は常に蒼天だ』は、いくつか言い方が考えられますが、例えば、
No matter how cloudy it gets, there is always a blue sky above the clouds. と言えます。
また、少し変えて
Even when the sky is filled with clouds, the sun still shines above. と表現することもできます。
日本語にすると『たとえ空が雲いっぱいでも、太陽はその上で輝いている。』となります。
参考になれば幸いです。