どの構造のどの層を測定しますか？って英語でなんて言うの？

ご質問ありがとうございます。 "For which structure and its layer"＝「どの構造のものの、どの層のために」 "do you need the measurement?"＝「測定が必要ですか。」 又は、順番を逆さまにして"The measurement you require is for which structure and its layer?"という表現も使えます。 ご参考になると幸いです。