The longer you let the sample stay in the atmosphere, the worse the sample's condition will be.
ご質問ありがとうございます。
"The longer you let the sample stay in the atmosphere,"=「大気中にサンプルを放置しておけばするほど」
"the worse the sample's condition will be."=「サンプルの状態が悪くなる。」
「~するほど、より~になる」の他の例文も書いておきます:
"The more you clean, the more beautiful the house will become."=「掃除すればするほど、家は綺麗になる。」
ご参考に。