A stray cat comes often into my garden and uses it as his toilet. It's problematic.
ご質問ありがとうございます。
"A stray cat often comes into my garden"=「野良猫がよく庭に来ます」
"and uses it as his toilet."=「自分のトイレとして使っています。」
(☆これは少し遠回しな言い方なので、"and he poops there"=「そして彼はそこでフンをする」が原文に最も近い表現です。)
"It's problematic."=「困っています。」
ご参考に。