The person in charge told us that they have established a new company and asked us to make contact with them from now on.
「取引する」は英語にするといろいろな言い方があると思いますが、この文脈だと
「(別会社と)新たに契約を結んで(ビジネスを)やっていってください」という解釈にしたので、上記のような訳出になりました。
その他の単語メモ:
担当者 a person in charge
会社を設立する to establish a new company
今後は from now on