病院で処方されるお薬なので、市販薬ではありませんって英語でなんて言うの？

ーThat's a prescribed medicine, you can't buy it over the counter.
「それは処方箋のいる薬なので、処方箋なしでは買えません」
市販薬のことは over the counter を使って表現するのが一般的です。

ーThat's not the kind of medicine you can buy at a drugstore, you need a prescription for it.
「それはドラッグストアで買える種類の薬ではありません。処方箋が必要ですよ」
prescription「処方箋」を覚えておくと便利ですよ。

ご参考まで！