この場合、次のような言い方ができますよ。
ーMy poorest subject is science.
「一番苦手な教科は理科です」
ーMy worst class is science.
「一番苦手なクラスは理科です」
苦手ではなく、一番嫌いな科目を言うなら、次のように言えます。
ーMy least favourite subject is science.
「一番嫌いな科目は理科です」
反対に得意な教科を言う場合は、次のように言えます。
ーMy best class is math.
「私の一番得意なクラスは数学です」
ーMy strongest class is math.
「私の一番得意なクラスは数学です」
ご参考まで!