ちょっと訳があって　って英語でなんて言うの？

この場合、次のように言うと良いでしょう。

ーI had my reasons.
「私なりの理由があった」

ーI didn't do it for nothing.
「理由もなくそれをしたわけではない」

例：
A: Why did you quit your job suddenly?
「なんで急に仕事を辞めたの？」

B: I had my reasons. Things have been bothering me for a while.
「ちょっと訳があって。しばらく悩んでいることがあってね」

ご参考まで！