The purpose of this system is to have the parent company collect the service provision fee from its subsidiary company.
ご質問ありがとうございます。
"The purpose of this system is"=「この制度の目的は」
"to have the parent company collect the service provision fee from its subsidiary company."=「親会社が子会社から役員提供費用を回収することです。」
( ☆ "subsidiary company" の "company" は省略することも可能です。)
ご参考になると幸いです。