When choosing which job to do, it is important to consider how rewarding that job is.
How rewarding the job is, is important.
ご質問ありがとうございます。
確かに*be*動詞が続くのは、すこし違和感がありますが、文法的にはOKです。
*is*を続ける他の文章として
*How rewarding the job is, is important.*=「仕事は、どれほどやりがいがあるかが重要である」という言い方も出来ます。
他には
*When choosing which job to do*=「どの仕事をするか選ぶとき」
*it is important to consider how rewarding that job is.*=「その仕事がどれほどやりがいがあるかを考慮することが大事である。」
ご参考までに。