こんにちは！
ご質問ありがとうございます。
ご質問について、『チャクラを整える』が、心身のバランスを整えるというようなニュアンスであれば、
To align chakras
とすると、『チャクラを整える』と言えます。
例文
Let's begin our practice by taking a few moments to breathe deeply and align chakras.
『深く息を吸い込んでチャクラを整えて練習を始めましょう。』
役に立ちそうな単語とフレーズ
breathe deeply 深く息を吸い込む、[深呼吸](https://eikaiwa.dmm.com/uknow/questions/11069/)する
参考になれば幸いです。
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