The first mode of transportation I took after I arrived in Japan was an express train.
詳しいシチュエーションなどがわかりませんが、次のような言い方ができると思います。
ーThe first mode of transportation I took after I arrived in Japan was an express train.
「日本について最初に乗った乗り物は特急列車です」
mode of transportation で「交通手段」
express train で「特急列車」
ご参考まで!