その貨物列車はたくさんの貨物を運んでいたって英語でなんて言うの？

この場合、次のような言い方ができますよ。

ーThat cargo train was carrying a lot of freight.
「その貨物列車はたくさんの貨物を運んでいた」
cargo train「貨物列車」
freight「貨物」

ーThat freight train was transporting a lot of goods.
「その貨物列車はたくさんの貨物を運んでいた」
freight train「貨物列車」
goods「貨物」

ご参考まで！