First, you should apologize, tell them the progress, and let them know when it will be done.
The first thing to do is to apologize, then tell them the present situation, and when you will finish.
apologizeは謝るの正式な言い方です。「まずは」はFirst, firstly, the first thing to do, first at all 等の言い方があります。progressは経過と言う意味です。現状を伝える事と同じ意味になりますので一文目で使用しました。when it will be doneはいつ終るか、when you will finishは、あなたがいつ終えるか、になります。
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