〜してくれていたのにって英語でなんて言うの？

「してくれていたのに。。」という意図を伝えたいのであれば、まず「謝意」を（改めて）伝えた上で、「しかしながら（However）・・・」と切り出せば良いと思います。

こんにちは！ ご質問ありがとうございます。 ご質問について、いくつか言い方が考えられますが、例えば、 I know you've already put time and effort into the report, and I'm sorry, but we no longer need it. とすると、「報告書のために、せっかく時間と[手間](https://eikaiwa.dmm.com/uknow/questions/68511/)をかけてくださっていたのに申し訳ないのですが、その報告書はもう必要なくなりました。」となります。 役に立ちそうな単語とフレーズ put time and effort into 時間と労力をかける no longer need もう必要としていない keep working on 続けて取り組む 参考になれば幸いです。