十時半から15分ほど離席するのでその間にお願いできますかって英語でなんて言うの？

be away: 離席している

作業の内容は事前に話されているはずなので"it" や"the work" など簡単な言葉で代用できますね。一つの文にまとめてしまおうと思わずに、会話の場合は特に短い文に分けてしまうのがコツです。

「cover for someone」や「take over for someone」は「誰かが離席する間に、同僚も上司も気づかないようにその離席している人の仕事を預かってあげる」と言う意味です。そのうえ、場合によって「同僚や上司が離席している人の行方に対して質問をしたら説明する」と言う意味もあります。しかし、その「説明する」ということはよく「嘘をつく」と言う感じです。