企業で「受付をする」って英語でなんて言うの？

「受付をする」は色々な言い方があります。例えば、

to check in at reception
to report to reception
to sign in at reception
という言い方を全て使えます。

「check in」は日本語の「チェックイン」に似ているニュアンスがありますので主にホテル、空港などの場所で使う言い方になります。

会社の受付で「受付する」場合には、「to sign in at reception」や「to report to reception」の方が自然だと思います。

飛行機やホテルと同じく、チェックインです。

「受付カウンターで受け付けした？（受付の人が）来訪者バッジをくれなかった？」というかんじの意味です。

受付係が誰かを受付するのは、check (someone) inと言えます。