こんにちは。
・Don't you think they'll be confused?
「彼らが混乱すると思いませんか?」
・Do you think the audience will be confused?
「聴衆が混乱すると思いますか?」
上記のような言い方ができます。
Don't と Do どちらを使っても問題ないですが、Don't だと「思いませんか?」、Do だと「思いますか?」のように微妙にニュアンスが異なります。
audience は「聴衆」「聞き手」の意味です。
ぜひ参考にしてください。