In order for you both to finish your treatments at the same time, the one taking the shorter treatment will come into the room during the other's treatment.
「時間差」は「time difference」ですが、この場合ではその意味を短い表現にすることは難しいです。「after the amount of time by which your treatments differ」とかになってしまうので、その意味を仮定させると思います。「the one taking the shorter treatment will come into the room during the other's treatment.」と言ったら、その意味が通じると思います。でも、とにかく長いですね…
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