例えば
I received an e-mail from Tom and read it twice.
という文の it は前の an e-mail を指しますが、
I'd appreciate it if you could help me.
の it は後ろの if 以下を指します。
このように、複雑な文の代名詞が何を指しているのかをたずねる言い方を知りたいです。
代名詞 "it" が何を指しているかを問う場合、"What does "it" refer to in this context?" という表現を使えます。"refer to" は「指す」という意味で、どの名詞が "it" によって置き換えられているのかを尋ねる際に用います。
他の言い方も可能です:
Can you clarify what the "it" stands for here?
To what is "it" alluding in this sentence?
日本 
アメリカ合衆国 
