You have a very small chance of seeing her when you come here.
She's rarely at home when you come here.
「家に」を at home と言う場合は２番めの文になります。
「あまり」は rarely（めったに〜ない）を使いました。
１つ目の文は、「ほとんど会える可能性がない」という文です。
「家に」は言っていませんが、文の意味から「ここに来る時」の「ここ」は家のことなので、あえて言う必要がない場面と考えています。
この場合、次のような言い方ができますよ。
ーShe's not here most of the time when you come.
「あなたが来ると、彼女はほとんどの時ここにいません」
ーShe's seldom here when you come to the house.
「あなたが家に来るとき、彼女はめったにここにいません」
ご参考まで！
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