I want to integrate the new system with the current one.
既存のシステムは、the existing systemとも言えます。
英文は「the new system: 新しいシステム」としましたが、
「(別の)新しいよく似たシステム」と言いたければ
a new system which is similar to the existing one.
としてもいいです。
We want to integrate the existing system into another system.
・We want to integrate the existing system into another system. 「既存のシステムを別のシステムに統合したいと思います。」
また、他の言い方も紹介します:
・We plan to merge the current system with a new one. 「現在のシステムを新しいシステムと統合する予定です。」
・We aim to incorporate the features of the existing system into a new system. 「既存システムの機能を新しいシステムに取り入れたいと思います。」
・We intend to consolidate the existing system with the new system we're developing. 「今開発中の新しいシステムと既存システムを統合するつもりです。」